作者：Roadmap Epigenomics Consortium ; Anshul Kundaje ; Wouter Meuleman ; Jason Ernst ; Misha Bilenky ; Angela Yen ; Alireza Heravi-Moussavi ; Pouya Kheradpour ; Zhizhuo Zhang ; Jianrong Wang ; Michael J. Ziller ; Viren Amin ; John W. Whitaker ; Matthew D. Schultz ; Lucas D. Ward ; Abhishek Sarkar ; Gerald Quon ; Richard S. Sandstrom ; Matthew L. Eaton ; Yi-Chieh Wu ; Andreas R. Pfenning ; Xinchen Wang ; Melina Claussnitzer ; Yaping Liu ; Cristian Coarfa ; R. Alan Harris ; Noam Shoresh ; Charles B. Epstein ; Elizabeta Gjoneska ; Danny Leung ; Wei Xie ; R. David Hawkins ; Ryan Lister ; Chibo Hong ; Philippe Gascard ; Andrew J. Mungall ; Richard Moore ; Eric Chuah ; Angela Tam ; Theresa K. Canfield ; R. Scott Hansen ; Rajinder Kaul ; Peter J. Sabo ; Mukul S. Bansal ; Annaick Carles ; Jesse R. Dixon ; Kai-How Farh ; Soheil Feizi ; Rosa Karlic ; Ah-Ram Kim ; Ashwinikumar Kulkarni ; Daofeng Li ; Rebecca Lowdon ; GiNell Elliott ; Tim R. Mercer ; Shane J. Neph ; Vitor Onuchic ; Paz Polak ; Nisha Rajagopal ; Pradipta Ray ; Richard C. Sallari ; Kyle T. Siebenthall ; Nicholas A. Sinnott-Armstrong ; Michael Stevens ; Robert E. Thurman ; Jie Wu ; Bo Zhang ; Xin Zhou ; Arthur E. Beaudet ; Laurie A. Boyer ; Philip L. De Jager ; Peggy J. Farnham ; Susan J. Fisher ; David Haussler ; Steven J. M. Jones ; Wei Li ; Marco A. Marra ; Michael T. McManus ; Shamil Sunyaev ; James A. Thomson ; Thea D. Tlsty ; Li-Huei Tsai ; Wei Wang ; Robert A. Waterland ; Michael Q. Zhang ; Lisa H. Chadwick ; Bradley E. Bernstein ; Joseph F. Costello ; Joseph R. Ecker ; Martin Hirst ; Alexander Meissner ; Aleksandar Milosavljevic ; Bing Ren ; John A. Stamatoyannopoulos ; Ting Wang ; Manolis Kellis ; Roadmap Epigenomics Consortium

关键词：Epigenomics ; Data integration ; Regulatory networks ; Genome-wide association studies

刊名：Nature

出版年：2015

作者：Alan P. Boyle ; Carlos L. Araya ; Cathleen Brdlik ; Philip Cayting ; Chao Cheng ; Yong Cheng ; Kathryn Gardner ; LaDeana W. Hillier ; Judith Janette ; Lixia Jiang ; Dionna Kasper ; Trupti Kawli ; Pouya Kheradpour ; Anshul Kundaje ; Jingyi Jessica Li ; Lijia Ma ; Wei Niu ; E. Jay Rehm ; Joel Rozowsky ; Matthew Slattery ; Rebecca Spokony ; Robert Terrell ; Dionne Vafeados ; Daifeng Wang ; Peter Weisdepp ; Yi-Chieh Wu ; Dan Xie ; Koon-Kiu Yan ; Elise A. Feingold ; Peter J. Good ; Michael J. Pazin ; Haiyan Huang ; Peter J. Bickel ; Steven E. Brenner ; Valerie Reinke ; Robert H. Waterston ; Mark Gerstein ; Kevin P. White ; Manolis Kellis ; Michael Snyder

关键词：Comparative genomics ; Evolutionary genetics ; Gene regulatory networks ; Evolutionary biology

刊名：Nature

出版年：2014

作者：Nicolas Nè ; gre ; Christopher D. Brown ; Lijia Ma ; Christopher Aaron Bristow ; Steven W. Miller ; Ulrich Wagner ; Pouya Kheradpour ; Matthew L. Eaton ; Paul Loriaux ; Rachel Sealfon ; Zirong Li ; Haruhiko Ishii ; Rebecca F. Spokony ; Jia Chen ; Lindsay Hwang ; Chao Cheng ; Richard P. Auburn ; Melissa B. Davis ; Marc Domanus ; Parantu K. Shah ; Carolyn A. Morrison ; Jennifer Zieba ; Sarah Suchy ; Lionel Senderowicz ; Alec Victorsen ; Nicholas A. Bild ; A. Jason Grundstad ; David Hanley ; David M. MacAlpine ; Mattias Mannervik ; Koen Venken ; Hugo Bellen ; Robert White ; Mark Gerstein ; Steven Russell ; Robert L. Grossman ; Bing Ren ; James W. Posakony ; Manolis Kellis ; Kevin P. White

关键词：Genetics and genomics ; Molecular biology

刊名：Nature

出版年：2011

作者：Jason Ernst ; Pouya Kheradpour ; Tarjei S. Mikkelsen ; Noam Shoresh ; Lucas D. Ward ; Charles B. Epstein ; Xiaolan Zhang ; Li Wang ; Robbyn Issner ; Michael Coyne ; Manching Ku ; Timothy Durham ; Manolis Kellis ; Bradley E. Bernstein

关键词：Genetics and genomics

刊名：Nature

出版年：2011

作者：Kerstin Lindblad-Toh ; Manuel Garber ; Or Zuk ; Michael F. Lin ; Brian J. Parker ; Stefan Washietl ; Pouya Kheradpour ; Jason Ernst ; Gregory Jordan ; Evan Mauceli ; Lucas D. Ward ; Craig B. Lowe ; Alisha K. Holloway ; Michele Clamp ; Sante Gnerre ; Jessica Alfö ; ldi ; Kathryn Beal ; Jean Chang ; Hiram Clawson ; James Cuff ; Federica Di Palma ; Stephen Fitzgerald ; Paul Flicek ; Mitchell Guttman ; Melissa J. Hubisz ; David B. Jaffe ; Irwin Jungreis ; W. James Kent ; Dennis Kostka ; Marcia Lara ; Andre L. Martins ; Tim Massingham ; Ida Moltke ; Brian J. Raney ; Matthew D. Rasmussen ; Jim Robinson ; Alexander Stark ; Albert J. Vilella ; Jiayu Wen ; Xiaohui Xie ; Michael C. Zody ; Broad Institute Sequencing Platform and Whole Genome Assembly Team ; Kim C. Worley ; Christie L. Kovar ; Donna M. Muzny ; Richard A. Gibbs ; Baylor College of Medicine Human Genome Sequencing Center Sequencing Team ; Wesley C. Warren ; Elaine R. Mardis ; George M. Weinstock ; Richard K. Wilson ; Genome Institute at Washington University ; Ewan Birney ; Elliott H. Margulies ; Javier Herrero ; Eric D. Green ; David Haussler ; Adam Siepel ; Nick Goldman ; Katherine S. Pollard ; Jakob S. Pedersen ; Eric S. Lander ; Manolis Kellis

关键词：Genetics and genomics ; Evolution ; Genetics and genomics ; Disease

刊名：Nature

出版年：2011

作者：Nathaniel D. Heintzman ; Gary C. Hon ; R. David Hawkins ; Pouya Kheradpour ; Alexander Stark ; Lindsey F. Harp ; Zhen Ye ; Leonard K. Lee ; Rhona K. Stuart ; Christina W. Ching ; Keith A. Ching ; Jessica E. Antosiewicz-Bourget ; Hui Liu ; Xinmin Zhang ; Roland D. Green ; Victor V. Lobanenkov ; Ron Stewart ; James A. Thomson ; Gregory E. Crawford ; Manolis Kellis ; Bing Ren

刊名：Nature

出版年：2009

作者：Wesley C. Warren ; LaDeana W. Hillier ; Jennifer A. Marshall Graves ; Ewan Birney ; Chris P. Ponting ; Frank Grü ; tzner ; Katherine Belov ; Webb Miller ; Laura Clarke ; Asif T. Chinwalla ; Shiaw-Pyng Yang ; Andreas Heger ; Devin P. Locke ; Pat Miethke ; Paul D. Waters ; Fré ; dé ; ric Veyrunes ; Lucinda Fulton ; Bob Fulton ; Tina Graves ; John Wallis ; Xose S. Puente ; Carlos Ló ; pez-Otín ; Gonzalo R. Ordó ; ñ ; ez ; Evan E. Eichler ; Lin Chen ; Ze Cheng ; Janine E. Deakin ; Amber Alsop ; Katherine Thompson ; Patrick Kirby ; Anthony T. Papenfuss ; Matthew J. Wakefield ; Tsviya Olender ; Doron Lancet ; Gavin A. Huttley ; Arian F. A. Smit ; Andrew Pask ; Peter Temple-Smith ; Mark A. Batzer ; Jerilyn A. Walker ; Miriam K. Konkel ; Robert S. Harris ; Camilla M. Whittington ; Emily S. W. Wong ; Neil J. Gemmell ; Emmanuel Buschiazzo ; Iris M. Vargas Jentzsch ; Angelika Merkel ; Juergen Schmitz ; Anja Zemann ; Gennady Churakov ; Jan Ole Kriegs ; Juergen Brosius ; Elizabeth P. Murchison ; Ravi Sachidanandam ; Carly Smith ; Gregory J. Hannon ; Enkhjargal Tsend-Ayush ; Daniel McMillan ; Rosalind Attenborough ; Willem Rens ; Malcolm Ferguson-Smith ; Christophe M. Lefè ; vre ; Julie A. Sharp ; Kevin R. Nicholas ; David A. Ray ; Michael Kube ; Richard Reinhardt ; Thomas H. Pringle ; James Taylor ; Russell C. Jones ; Brett Nixon ; Jean-Louis Dacheux ; Hitoshi Niwa ; Yoko Sekita ; Xiaoqiu Huang ; Alexander Stark ; Pouya Kheradpour ; Manolis Kellis ; Paul Flicek ; Yuan Chen ; Caleb Webber ; Ross Hardison ; Joanne Nelson ; Kym Hallsworth-Pepin ; Kim Delehaunty ; Chris Markovic ; Pat Minx ; Yucheng Feng ; Colin Kremitzki ; Makedonka Mitreva ; Jarret Glasscock ; Todd Wylie ; Patricia Wohldmann ; Prathapan Thiru ; Michael N. Nhan ; Craig S. Pohl ; Scott M. Smith ; Shunfeng Hou ; Mikhail Nefedov ; Pieter J. de Jong ; Marilyn B. Renfree ; Elaine R. Mardis ; Richard K. Wilson

刊名：Nature

出版年：2008

作者：Alexander Stark ; Michael F. Lin ; Pouya Kheradpour ; Jakob S. Pedersen ; Leopold Parts ; Joseph W. Carlson ; Madeline A. Crosby ; Matthew D. Rasmussen ; Sushmita Roy ; Ameya N. Deoras ; J. Graham Ruby ; Julius Brennecke ; Harvard FlyBase curators ; Berkeley Drosophila Genome Project ; Emily Hodges ; Angie S. Hinrichs ; Anat Caspi ; Benedict Paten ; Seung-Won Park ; Mira V. Han ; Morgan L. Maeder ; Benjamin J. Polansky ; Bryanne E. Robson ; Stein Aerts ; Jacques van Helden ; Bassem Hassan ; Donald G. Gilbert ; Deborah A. Eastman ; Michael Rice ; Michael Weir ; Matthew W. Hahn ; Yongkyu Park ; Colin N. Dewey ; Lior Pachter ; W. James Kent ; David Haussler ; Eric C. Lai ; David P. Bartel ; Gregory J. Hannon ; Thomas C. Kaufman ; Michael B. Eisen ; Andrew G. Clark ; Douglas Smith ; Susan E. Celniker ; William M. Gelbart ; Manolis Kellis ; Harvard FlyBase curators ; Berkeley Drosophila Genome Project

刊名：Nature

出版年：2007