作者：Jyoti Shankar ; Norma V. Solis ; Stephanie Mounaud ; Sebastian Szpakowski ; Hong Liu ; Liliana Losada ; William C. Nierman ; Scott G. Filler

关键词：Statistical methods ; Next-generation sequencing ; Fungal host response ; Microbiome

刊名：Scientific Reports

出版年：2015

作者：William C. Nierman ; Arnab Pain ; Michael J. Anderson ; Jennifer R. Wortman ; H. Stanley Kim ; Javier Arroyo ; Matthew Berriman ; Keietsu Abe ; David B. Archer ; Clara Bermejo ; Joan Bennett ; Paul Bowyer ; Dan Chen ; Matthew Collins ; Richard Coulsen ; Robert Davies ; Paul S. Dyer ; Mark Farman ; Nadia Fedorova ; Natalie Fedorova ; Tamara V. Feldblyum ; Reinhard Fischer ; Nigel Fosker ; Audrey Fraser ; Jose L. García ; Maria J. García ; Arlette Goble ; Gustavo H. Goldman ; Katsuya Gomi ; Sam Griffith-Jones ; Ryan Gwilliam ; Brian Haas ; Hubertus Haas ; David Harris ; H. Horiuchi ; Jiaqi Huang ; Sean Humphray ; Javier Jimé ; nez ; Nancy Keller ; Hoda Khouri ; Katsuhiko Kitamoto ; Tetsuo Kobayashi ; Sven Konzack ; Resham Kulkarni ; Toshitaka Kumagai ; Anne Lafton ; Jean-Paul Latgé ; Weixi Li ; Angela Lord ; Charles Lu ; William H. Majoros ; Gregory S. May ; Bruce L. Miller ; Yasmin Mohamoud ; Maria Molina ; Michel Monod ; Isabelle Mouyna ; Stephanie Mulligan ; Lee Murphy ; Susan O' ; Neil ; Ian Paulsen ; Miguel A. Peñ ; alva ; Mihaela Pertea ; Claire Price ; Bethan L. Pritchard ; Michael A. Quail ; Ester Rabbinowitsch ; Neil Rawlins ; Marie-Adele Rajandream ; Utz Reichard ; Hubert Renauld ; Geoffrey D. Robson ; Santiago Rodriguez de Có ; rdoba ; Jose M. Rodrí ; guez-Peña ; Catherine M. Ronning ; Simon Rutter ; Steven L. Salzberg ; Miguel Sanchez ; Juan C. Sá ; nchez-Ferrero ; David Saunders ; Kathy Seeger ; Rob Squares ; Steven Squares ; Michio Takeuchi ; Fredj Tekaia ; Geoffrey Turner ; Carlos R. Vazquez de Aldana ; Janice Weidman ; Owen White ; John Woodward ; Jae-Hyuk Yu ; Claire Fraser ; James E. Galagan ; Kiyoshi Asai ; Masayuki Machida ; Neil Hall ; Bart Barrelland David W. Denning

刊名：Nature

出版年：2005

作者：William C. Nierman ; Arnab Pain ; Michael J. Anderson ; Jennifer R. Wortman ; H. Stanley Kim ; Javier Arroyo ; Matthew Berriman ; Keietsu Abe ; David B. Archer ; Clara Bermejo ; Joan Bennett ; Paul Bowyer ; Dan Chen ; Matthew Collins ; Richard Coulsen ; Robert Davies ; Paul S. Dyer ; Mark Farman ; Nadia Fedorova ; Natalie Fedorova ; Tamara V. Feldblyum ; Reinhard Fischer ; Nigel Fosker ; Audrey Fraser ; Jose L. García ; Maria J. García ; Arlette Goble ; Gustavo H. Goldman ; Katsuya Gomi ; Sam Griffith-Jones ; Ryan Gwilliam ; Brian Haas ; Hubertus Haas ; David Harris ; H. Horiuchi ; Jiaqi Huang ; Sean Humphray ; Javier Jimé ; nez ; Nancy Keller ; Hoda Khouri ; Katsuhiko Kitamoto ; Tetsuo Kobayashi ; Sven Konzack ; Resham Kulkarni ; Toshitaka Kumagai ; Anne Lafon ; Jean-Paul Latgé ; Weixi Li ; Angela Lord ; Charles Lu ; William H. Majoros ; Gregory S. May ; Bruce L. Miller ; Yasmin Mohamoud ; Maria Molina ; Michel Monod ; Isabelle Mouyna ; Stephanie Mulligan ; Lee Murphy ; Susan O' ; Neil ; Ian Paulsen ; Miguel A. Peñ ; alva ; Mihaela Pertea ; Claire Price ; Bethan L. Pritchard ; Michael A. Quail ; Ester Rabbinowitsch ; Neil Rawlins ; Marie-Adele Rajandream ; Utz Reichard ; Hubert Renauld ; Geoffrey D. Robson ; Santiago Rodriguez de Có ; rdoba ; Jose M. Rodrí ; guez-Peña ; Catherine M. Ronning ; Simon Rutter ; Steven L. Salzberg ; Miguel Sanchez ; Juan C. Sá ; nchez-Ferrero ; David Saunders ; Kathy Seeger ; Rob Squares ; Steven Squares ; Michio Takeuchi ; Fredj Tekaia ; Geoffrey Turner ; Carlos R. Vazquez de Aldana ; Janice Weidman ; Owen White ; John Woodward ; Jae-Hyuk Yu ; Claire Fraser ; James E. Galagan ; Kiyoshi Asai ; Masayuki Machida ; Neil Hall ; Bart Barrell ; David W. Denning

刊名：Nature

出版年：2006

作者：Masayuki Machida ; Kiyoshi Asai ; Motoaki Sano ; Toshihiro Tanaka ; Toshitaka Kumagai ; Goro Terai ; Ken-Ichi Kusumoto ; Toshihide Arima ; Osamu Akita ; Yutaka Kashiwagi ; Keietsu Abe ; Katsuya Gomi ; Hiroyuki Horiuchi ; Katsuhiko Kitamoto ; Tetsuo Kobayashi ; Michio Takeuchi ; David W. Denning ; James E. Galagan ; William C. Nierman ; Jiujiang Yu ; David B. Archer ; Joan W. Bennett ; Deepak Bhatnagar ; Thomas E. Cleveland ; Natalie D. Fedorova ; Osamu Gotoh ; Hiroshi Horikawa ; Akira Hosoyama ; Masayuki Ichinomiya ; Rie Igarashi ; Kazuhiro Iwashita ; Praveen Rao Juvvadi ; Masashi Kato ; Yumiko Kato ; Taishin Kin ; Akira Kokubun ; Hiroshi Maeda ; Noriko Maeyama ; Jun-ichi Maruyama ; Hideki Nagasaki ; Tasuku Nakajima ; Ken Oda ; Kinya Okada ; Ian Paulsen ; Kazutoshi Sakamoto ; Toshihiko Sawano ; Mikio Takahashi ; Kumiko Takase ; Yasunobu Terabayashi ; Jennifer R. Wortman ; Osamu Yamada ; Youhei Yamagata ; Hideharu Anazawa ; Yoji Hata ; Yoshinao Koide ; Takashi Komori ; Yasuji Koyama ; Toshitaka Minetoki ; Sivasundaram Suharnan ; Akimitsu Tanaka ; Katsumi Isono ; Satoru Kuhara ; Naotake Ogasawaraand Hisashi Kikuchi

刊名：Nature

出版年：2005

作者：James E. Galagan ; Sarah E. Calvo ; Christina Cuomo ; Li-Jun Ma ; Jennifer R. Wortman ; Serafim Batzoglou ; Su-In Lee ; Meray Ba< ; img border=" ; 0" ; src=" ; /__chars/s/special/cedil/black/med/base/glyph.gif" ; align=" ; middle" ; /> ; tü ; rkmen ; Christina C. Spevak ; John Clutterbuck ; Vladimir Kapitonov ; Jerzy Jurka ; Claudio Scazzocchio ; Mark Farman ; Jonathan Butler ; Seth Purcell ; Steve Harris ; Gerhard H. Braus ; Oliver Draht ; Silke Busch ; Christophe D' ; Enfert ; Christiane Bouchier ; Gustavo H. Goldman ; Deborah Bell-Pedersen ; Sam Griffiths-Jones ; John H. Doonan ; Jaehyuk Yu ; Kay Vienken ; Arnab Pain ; Michael Freitag ; Eric U. Selker ; David B. Archer ; Miguel Á ; . Peñ ; alva ; Berl R. Oakley ; Michelle Momany ; Toshihiro Tanaka ; Toshitaka Kumagai ; Kiyoshi Asai ; Masayuki Machida ; William C. Nierman ; David W. Denning ; Mark Caddick ; Michael Hynes ; Mathieu Paoletti ; Reinhard Fischer ; Bruce Miller ; Paul Dyer ; Matthew S. Sachs ; Stephen A. Osmaniand Bruce W. Birren

刊名：Nature

出版年：2005

作者：Timothy D. Read ; Scott N. Peterson ; Nicolas Tourasse ; Les W. Baillie ; Ian T. Paulsen ; Karen E. Nelson ; Hervé ; Tettelin ; Derrick E. Fouts ; Jonathan A. Eisen ; Steven R. Gill ; Erik K. Holtzapple ; Ole Andreas Ø ; kstad ; Erlendur Helgason ; Jennifer Rilstone ; Martin Wu ; James F. Kolonay ; Maureen J. Beanan ; Robert J. Dodson ; Lauren M. Brinkac ; Michelle Gwinn ; Robert T. DeBoy ; Ramana Madpu ; Sean C. Daugherty ; A. Scott Durkin ; Daniel H. Haft ; William C. Nelson ; Jeremy D. Peterson ; Mihai Pop ; Hoda M. Khouri ; Diana Radune ; Jonathan L. Benton ; Yasmin Mahamoud ; Lingxia Jiang ; Ioana R. Hance ; Janice F. Weidman ; Kristi J. Berry ; Roger D. Plaut ; Alex M. Wolf ; Kisha L. Watkins ; William C. Nierman ; Alyson Hazen ; Robin Cline ; Caroline Redmond ; Joanne E. Thwaite ; Owen White ; Steven L. Salzberg ; Brendan Thomason ; Arthur M. Friedlander ; Theresa M. Koehler ; Philip C. Hanna ; Anne-Brit Kolstø ; andClaire M. Fraser

刊名：Nature

出版年：2003

作者：Simon G. Gregory ; Mandeep Sekhon ; Jacqueline Schein ; Shaying Zhao ; Kazutoyo Osoegawa ; Carol E. Scott ; Richard S. Evans ; Paul W. Burridge ; Tony V. Cox ; Christopher A. Fox ; Richard D. Hutton ; Ian R. Mullenger ; Kimbly J. Phillips ; James Smith ; Jim Stalker ; Glen J. Threadgold ; Ewan Birney ; Kristine Wylie ; Asif Chinwalla ; John Wallis ; LaDeana Hillier ; Jason Carter ; Tony Gaige ; Sara Jaeger ; Colin Kremitzki ; Dan Layman ; Jason Maas ; Rebecca McGrane ; Kelly Mead ; Rebecca Walker ; Steven Jones ; Michael Smith ; Jennifer Asano ; Ian Bosdet ; Susanna Chan ; Suganthi Chittaranjan ; Readman Chiu ; Chris Fjell ; Dan Fuhrmann ; Noreen Girn ; Catharine Gray ; Ran Guin ; Letticia Hsiao ; Martin Krzywinski ; Reta Kutsche ; Soo Sen Lee ; Carrie Mathewson ; Candice McLeavy ; Steve Messervier ; Steven Ness ; Pawan Pandoh ; Anna-Liisa Prabhu ; Parvaneh Saeedi ; Duane Smailus ; Lorraine Spence ; Jeff Stott ; Sheryl Taylor ; Wesley Terpstra ; Miranda Tsai ; Jill Vardy ; Natasja Wye ; George Yang ; Sofiya Shatsman ; Bola Ayodeji ; Keita Geer ; Getahun Tsegaye ; Alla Shvartsbeyn ; Elizabeth Gebregeorgis ; Margaret Krol ; Daniel Russell ; Larry Overton ; Joel A. Malek ; Mike Holmes ; Michael Heaney ; Jyoti Shetty ; Tamara Feldblyum ; William C. Nierman ; Joseph J. Catanese ; Tim Hubbard ; Robert H. Waterston ; Jane Rogers ; Pieter J. de Jong ; Claire M. Fraser ; Marco Marra ; John D. McPhersonandDavid R. Bentley

刊名：Nature

出版年：2002

作者：Athanasios Theologis ; Joseph R. Ecker ; Curtis J. Palm ; Nancy A. Federspiel ; Samir Kaul ; Owen White ; Jose Alonso ; Hootan Altafi ; Rina Araujo ; Cheryl L. Bowman ; Shelise Y. Brooks ; Eugen Buehler ; April Chan ; Qimin Chao ; Huaming Chen ; Rosa F. Cheuk ; Christina W. Chin ; Mike K. Chung ; Lane Conn ; Aaron B. Conway ; Andrew R. Conway ; Todd H. Creasy ; Ken Dewar ; Patrick Dunn ; Pelin Etgu ; Tamara V. Feldblyum ; JiDong Feng ; Betty Fong ; Claire Y. Fujii ; John E. Gill ; Andrew D. Goldsmith ; Brian Haas ; Nancy F. Hansen ; Beth Hughes ; Lucas Huizar ; Jonathan L. Hunter ; Jennifer Jenkins ; Chanda Johnson-Hopson ; Shehnaz Khan ; Elizabeth Khaykin ; Christopher J. Kim ; Hean L. Koo ; Irina Kremenetskaia ; David B. Kurtz ; Andrea Kwan ; Bao Lam ; Stephanie Langin-Hooper ; Andrew Lee ; Jeong M. Lee ; Catherine A. Lenz ; Joycelyn. H. Li ; YaPing Li ; Xiaoying Lin ; Shirley X. Liu ; Zhaoying A. Liu ; Jason S. Luros ; Rama Maiti ; Andre Marziali ; Jennifer Militscher ; Molly Miranda ; Michelle Nguyen ; William C. Nierman ; Brian I. Osborne ; Grace Pai ; Jeremy Peterson ; Paul K. Pham ; Michael Rizzo ; Timothy Rooney ; Don Rowley ; Hitomi Sakano ; Steven L. Salzberg ; Jody R. Schwartz ; Paul Shinn ; Audrey M. Southwick ; Hui Sun ; Luke J. Tallon ; Gabriel Tambunga ; Mitsue J. Toriumi ; Christopher D. Town ; Teresa Utterback ; Susan Van Aken ; Maria Vaysberg ; Valentina S. Vysotskaia ; Michelle Walker ; Dongying Wu ; Guixia Yu ; Claire M. Fraser ; J. Craig VenterandRonald W. Davis

刊名：Nature

出版年：2000

作者：John F. Heidelberg ; Jonathan A. Eisen ; William C. Nelson ; Rebecca A. Clayton ; Michelle L. Gwinn ; Robert J. Dodson ; Daniel H. Haft ; Erin K. Hickey ; Jeremy D. Peterson ; Lowell Umayam ; Steven R. Gill ; Karen E. Nelson ; Timothy D. Read ; Hervé ; Tettelin ; Delwood Richardson ; Maria D. Ermolaeva ; Jessica Vamathevan ; Steven Bass ; Haiying Qin ; Ioana Dragoi ; Patrick Sellers ; Lisa McDonald ; Teresa Utterback ; Robert D. Fleishmann ; William C. Nierman ; Owen White ; Steven L. Salzberg ; Hamilton O. Smith ; Rita R. Colwell ; John J. Mekalanos ; J. Craig VenterandClaire M. Fraser

刊名：Nature

出版年：2000

作者：Xiaoying Lin ; Samir Kaul ; Steve Rounsley ; Terrance P. Shea ; Maria-Ines Benito ; Christopher D. Town ; Claire Y. Fujii ; Tanya Mason ; Cheryl L. Bowman ; Mary Barnstead ; Tamara V. Feldblyum ; C. Robin Buell ; Karen A. Ketchum ; John Lee ; Catherine M. Ronning ; Hean L. Koo ; Kelly S. Moffat ; Lisa A. Cronin ; Mian Shen ; Grace Pai ; Susan Van Aken ; Lowell Umayam ; Luke J. Tallon ; John E. Gill ; Mark D. Adams ; Ana J. Carrera ; Todd H. Creasy ; Howard M. Goodman ; Chris R. Somerville ; Greg P. Copenhaver ; Daphne Preuss ; William C. Nierman ; Owen White ; Jonathan A. Eisen ; Steven L. Salzberg ; Claire M. FraserandJ. Craig Venter

刊名：Nature

出版年：1999