作者：Benoî ; t Gilquin^a ; ^b ; ^c ; Mathilde Louwagie^a ; ^b ; ^c ; Michel Jaquinod^a ; ^b ; ^c ; Alexandre Cez^d ; Guillaume Picard^a ; ^b ; ^c ; Leila El Kholy^a ; ^b ; ^c ; Brigitte Surin^e ; Jé ; rô ; me Garin^a ; ^b ; ^c ; Myriam Ferro^a ; ^b ; ^c ; Thomas Kofman^f ; Caroline Barau^g ; Emmanuelle Plaisier^d ; ^e ; ^h ; Pierre Ronco^d ; ^e ; ^h ; Virginie Brun^a ; ^b ; ^c ; ^{virginie.brun@cea.fr}

关键词：AKI ; acute kidney injury ; L-FABP ; liver fatty acid-binding protein ; MED-FASP ; multiple enzyme digestion &ndash ; filter aided sample preparation ; MIOX ; myo-inositol oxygenase ; NGAL ; Neutrophil gelatinase-associated lipocalin ; PCK1 ; phosphoenolpyruvate carboxykinase 1 ; SRM ; Selected Reaction Monitoring ; PSAQ ; Protein Standard Absolute Quantification

刊名：Talanta

出版年：2017

作者：Liliane Hobeika¹ ; Michelle T. Barati¹ ; Dawn J. Caster¹ ; ² ; Kenneth R. McLeish¹ ; ² ; ³ ; Michael L. Merchant¹ ; ³ ; ^{mlmerc02@exchange.louisville.edu}

关键词：extracellular matrix ; glomeruli ; human ; laser capture microdissection ; mass spectrometry

刊名：Kidney International

出版年：2017

作者：Vital Vialas^a ; ¹ ; Nú ; ria Colomé ; -Calls^b ; ¹ ; Joaquí ; n Abian^c ; Kerman Aloria^d ; Gloria Alvarez-Llamas^e ; Oreto Antú ; nez^f ; Jesus M. Arizmendi^g ; Mikel Azkargorta^h ; Silvia Barceló ; -Batlloriⁱ ; Marí ; a G. Barderas^j ; Francisco Blanco^k ; J. Ignacio Casal^l ; Vanessa Casas^c ; Carolina de la Torreⁱ ; Eduardo Chicano-Gá ; lvez^m ; Felix Elortza^h ; Guadalupe Espadasⁿ ; Josep M. Estanyol^o ; Joaquí ; n Fernandez-Irigoyen^p ; Patricia Fernandez-Puente^k ; Marí ; a José ; Fidalgo^o ; Manuel Fuentes^q ; Marina Gay^r ; Concha Gil^a ; Alexandre Hainard^s ; Maria Luisa Hernaez^a ; Nieves Ibarrola^q ; Arthur T. Kopylov^t ; Antonio Lario^u ; Juan Antonio Lopez^v ; Marí ; a Ló ; pez-Lucendo^l ; Miguel Marcilla^w ; Anabel Marina-Ramí ; rez^x ; Gyorgy Marko-Varga^y ; Luna Martí ; n^b ; Maria I. Mora^z ; Esperanza Morato-Ló ; pez^x ; Javier Muñ ; oz^aa ; Maria Antonia Odena^ab ; Eliandre de Oliveira^ab ; Irene Orera^ac ; Ignacio Ortea^m ; Carla Pasquarello^s ; Kevin B. Ray^ad ; Melinda Rezeli^y ; Isabel Ruppen^aa ; Eduard Sabidó ; ⁿ ; Manuel M. Sanchez del Pino^ae ; Jaime Sancho^u ; Enrique Santamarí ; a^p

关键词：Proteomics ; Liquid chromatography ; Targeted proteomics ; Reproducibility ; Standardization ; Inter-laboratory validation ; Multiple reaction monitoring

刊名：Journal of Proteomics

出版年：2017

作者：Claire Ramus^a ; ^d ; ^e ; ^f ; ¹ ; ^{claire.ramus@cea.fr" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author} ; Agnè ; s Hovasse^a ; ^g ; ¹ ; ^{ahovasse@unistra.fr" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author} ; Marlè ; ne Marcellin^a ; ^b ; ^c ; ¹ ; ^{marlene.marcellin@ipbs.fr" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author} ; Anne-Marie Hesse^a ; ^d ; ^e ; ^f ; ¹ ; ^{anne-marie.hesse@cea.fr" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author} ; Emmanuelle Mouton-Barbosa^a ; ^b ; ^c ; ^{emmanuelle.mouton@ipbs.fr" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author} ; David Bouyssié ; ^a ; ^b ; ^c ; ^{bouyssie@ipbs.fr" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author} ; Sebastian Vaca^a ; ^g ; ^{sebastian.vaca@etu.unistra.fr" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author} ; Christine Carapito^a ; ^g ; ^{ccarapito@unistra.fr" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author} ; Karima Chaoui^a ; ^b ; ^c ; ^{karima.chaoui@ipbs.fr" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author} ; Christophe Bruley^a ; ^d ; ^e ; ^f ; ^{christophe.bruley@cea.fr" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author} ; Jé ; rô ; me Garin^a ; ^d ; ^e ; ^f ; ^{jerome.garin@cea.fr" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author} ; Sarah Cianfé ; rani^a ; ^g ; ^{sarah.cianferani@unistra.fr" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author} ; Myriam Ferro^a ; ^d ; ^e ; ^f ; ^{myriam.ferro@cea.fr" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author} ; Alain Van Dorssaeler^a ; ^g ; ^{vandors@unistra.fr" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author} ; Odile Burlet-Schiltz^a ; ^b ; ^c ; ^{schiltz@ipbs.fr" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author} ; Christine Schaeffer^a ; ^g ; ^{christine.schaeffer@unistra.fr" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author} ; Yohann Couté ; ^a ; ^d ; ^e ; ^f ; ^{yohann.coute@cea.fr" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author} ; Anne Gonzalez de Peredo^a ; ^b ; ^c ; ^{gonzalez@ipbs.fr" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author}

关键词：Proteomic standard ; NanoLC&ndash ; MS/MS ; Label-free quantification ; Computational proteomics ; Spectral counting ; MS signal analysis

刊名：Journal of Proteomics

出版年：2016

作者：Claire Ramus^a ; ^d ; ^e ; ^f ; ¹ ; ; Agnè ; s Hovasse^a ; ^g ; ¹ ; ; Marlè ; ne Marcellin^a ; ^b ; ^c ; ¹ ; ; Anne-Marie Hesse^a ; ^d ; ^e ; ^f ; ¹ ; ; Emmanuelle Mouton-Barbosa^a ; ^b ; ^c ; ; David Bouyssié ; ^a ; ^b ; ^c ; ; Sebastian Vaca^a ; ^g ; ; Christine Carapito^a ; ^g ; ; Karima Chaoui^a ; ^b ; ^c ; ; Christophe Bruley^a ; ^d ; ^e ; ^f ; ; Jé ; rô ; me Garin^a ; ^d ; ^e ; ^f ; ; Sarah Cianfé ; rani^a ; ^g ; ; Myriam Ferro^a ; ^d ; ^e ; ^f ; ; Alain Van Dorssaeler^a ; ^g ; ; Odile Burlet-Schiltz^a ; ^b ; ^c ; ; Christine Schaeffer^a ; ^g ; ; Yohann Couté ; ^a ; ^d ; ^e ; ^f ; ; Anne Gonzalez de Peredo^a ; ^b ; ^c ; ^{gonzalez@ipbs.fr" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author} ;

刊名：Data in Brief

出版年：2016

作者：Luana Maggiore^a ; ² ; Lu Yu^b ; Ulrich Omasits^b ; ³ ; Omar Rossi^a ; ⁴ ; Gordon Dougan^b ; Nicholas R. Thomson^b ; Allan Saul^a ; ^{allan.j.saul@GSK.com" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author} ; Jyoti S. Choudhary^b ; ¹ ; Christiane Gerke^a ; ¹ ; ⁵

关键词：&minusp ; absence of virulence plasmid (either pSS or pINV) ; +p ; presence of virulence plasmid (either pSS or pINV) ; Cyto ; cytoplasm ; CytoM ; cytoplasmic membrane ; DOMV ; detergent-derived outer membrane vesicles ; E. coli ; Escherichia coli ; GMMA ; Generalized Modules for Membrane Antigens ; NOMV ; native outer membrane vesicles ; OM ; outer membrane ; OM lipo ; outer membrane lipoprotein ; OMV ; outer membrane vesicles ; OAg ; O antigen ; PP ; periplasm ; SD ; standard deviation ; Sf2a ; hyperblebbing plasmid-cure

刊名：International Journal of Medical Microbiology

出版年：2016

作者：Peter Valentin Tomazic^a ; ¹ ; ^{peter.tomazic@medunigraz.at" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author} ; Ruth Birner-Gruenberger^b ; ^c ; ^d ; ¹ ; ^{ruth.birner-gruenberger@medunigraz.at" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author} ; Anita Leitner^a ; Stefan Spoerk^b ; ^d ; ^e ; Doris Lang-Loidolt^a ; ²

关键词：AUC [%] ; mean normalized areas under the curve ; CID ; collision induced dissociation ; DTT ; dithiothreitol ; Fw-rev ; forward-reverse score ; IAA ; iodoacetamide ; ICR ; ion cyclotron resonance ; LC&ndash ; MS/MS ; liquid chromatography&ndash ; tandem mass spectrometry ; nano-HPLC ; nano-flow-high performance liquid chromatography ; SD ; standard deviation ; SEM ; standard error of mean ; %SPI ; Scored Peak Intensity Percent ; SPT ; skin prick test

刊名：Journal of Proteomics

出版年：2016

作者：Alessandro Lana ; Lello Zolla ; ^{zolla@unitus.it" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author}

关键词：Meat ; Tenderness ; Omics technologies ; Myofibrillar proteins ; Proteolytic enzymes

刊名：Journal of Proteomics

出版年：2016

作者：Adam T. Szafran^a ; Maureen G. Mancini^a ; Jeffrey A. Nickerson^b ; Dean P. Edwards^a ; ^c ; Michael A. Mancini^a ; ^{mancini@bcm.edu" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author}

关键词：HCA ; high content analysis ; HPA ; Human Protein Atlas ; IF ; immunofluorescence ; NM ; nuclear matrix ; PCA ; principle component analysis ; PLP ; Pipeline Pilot ; RF ; random partitioning/forest ; RSD ; relative standard deviation

刊名：Methods

出版年：2016

作者：David Y. Lou ; M.D. ; Ph.D.^a ; ^b ; Lawrence Fong ; M.D.^a ; ^b ; ^{lawrence.fong@ucsf.edu" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author}

关键词：Prostate cancer ; Neoadjuvant ; Preoperative ; Targeted therapy ; Immunotherapy

刊名：Urologic Oncology: Seminars and Original Investigations

出版年：2016