保加利亚乳杆菌N-乙酰胞壁质酶基因的克隆及生物信息学分析

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英文篇名：Cloning and bioinformatics analysis of Lactobacillus bulgaricus N-acetylmuramidase gene 作者：苏文政 ; 吴家强 ; 马建军 ; 黄保华 ; 蒋慧 ; 王可 ; 张玉玉 英文作者：Su Wenzheng; 关键词：保加利亚乳杆菌 ; N-乙酰胞壁质酶 ; 克隆 ; 生物信息学分析 中文刊名：江苏农业科学 英文刊名：Jiangsu Agricultural Sciences 机构：山东省农业科学院畜牧兽医研究所/山东省畜禽疫病防治与繁育重点实验室;山东省食品药品检验研究院; 出版日期：2019-08-30 15:22 出版单位：江苏农业科学 年：2019 期：15 基金：山东省农业科学院青年科研基金(编号:2015YQN52、2016YQN55);; 山东省农业重大应用技术创新项目[编号:农指(2014)38号];; 济南市金种子企业关键产品提升计划(编号:201502069) 语种：中文; 页：107-110 页数：4 CN：32-1214/S ISSN：1002-1302 分类号：Q78

摘要

为了研究保加利亚乳杆菌N-乙酰胞壁质酶基因的结构特征及编码蛋白的功能,根据GenBank中其基因的DNA序列设计引物,以保加利亚乳杆菌MN株的基因组为DNA模板,利用PCR技术扩增N-乙酰胞壁质酶基因,将其克隆到pMD-19T载体上,进行测序与生物信息学分析。结果表明,MN株N-乙酰胞壁质酶基因序列编码217个氨基酸,与GenBank中公开的N-乙酰胞壁质酶基因核苷酸序列的同源性为98.8%～100.0%;蛋白质的理论分子质量为24.55 ku,理论等电点为9.83;该蛋白属于亲水性蛋白,二级结构以α-螺旋为主;该蛋白的第16～38位氨基酸残基组成跨膜区,第56～216位氨基酸残基组成LYZ2结构域。研究结果为今后探讨N-乙酰胞壁质酶基因的生物学功能及其功能改造奠定了基础。
        

引文

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