黏菌主要类群内细菌多样性分析

详细信息    查看官网全文

• 论文作者：李姝 ; 亓宝 ; 彭雪嫣 ; 王琦 ; 李玉
• 年：2016
• 作者机构：吉林农业大学食药用菌教育部工程研究中心;
• 论文关键词：16S rDNA ; 遗传多样性 ; 系统发育
• 会议召开时间：2016-08-19
• 会议录名称：中国菌物学会2016年学术年会论文摘要集
• 英文会议录名称：Abstracts of 2016 Mycological Society of China Annual Meeting
• 语种：中文
• 分类号：Q949.31
• 学会代码：ZGVL
• 会议名称：中国菌物学会2016年学术年会
• 会议地点：中国福建福州
• 主办单位：中国菌物学会
• 学会名称：中国菌物学会
• 页数：1
• 文件大小：487k
• 原文格式：D
• 会议级别：全国

摘要

黏菌(Myxomycetes)是一类具有独特生活史的真核生物,可生活在多种基质上,包括腐木,活树皮,落叶,土壤等,在生活史的不同阶段分别具有类似真菌和动物的特征。细菌作为黏菌营养体的重要食物源,在黏菌原生质团和子实体阶段都能检测到细菌的存在,与黏菌具有十分密切的关系。为研究黏菌内细菌多样性,对来自6目9科33属的112份黏菌基因组DNA进行Illumina Miseq 16S测序,共获得OTUs 7077个,其中注释到种OTUs 1127个。选取测序丰度前25位的细菌进行比对发现,测试样品中假单胞菌目Pseudomonadales,根瘤菌目Rhizobiales,鞘脂单胞菌目Sphingomonadales,放线菌目Actinomycetales,伯克氏菌目Burkholderiales为共有细菌目;莫拉菌科Moraxellaceae,假单胞菌科Pseudomonadaceae为共有细菌科;不动杆菌属Acinetobacter,假单胞菌属Pseudomonas为共有细菌属。以上细菌多分布于土壤及水中,与分离自黏菌原生质团及子实体的细菌类群相似。比较黏菌个体间内细菌多样性,发现黏菌不同生长阶段与不同营养基质可造成黏菌内细菌的组成差异,生长于同一类型基质上的黏菌具有相似的内细菌类群,生长环境是影响黏菌内细菌主要类群的重要因素,但对种内共有细菌的分布影响较小。另外,黏菌的共有细菌类群的分子系统关系可能与黏菌的系统发育关系有着密切关联。

引文

李玉,李惠中,王琦,陈双林,2008.中国真菌志-黏菌卷一.北京:科学出版社
    Stephenson SL,Fiore-Donno AM,Schnittler M,2011.Myxomycetes in soil.Soil Biology&Biochemistry,43:2237-2242
    Gray WD,Alexopoulos CJ,1968.Biology of Myxomycetes.New York:Ronald Press
    Bonner JT,2010.Brainless behavior:a myxomycete chooses a balanced diet.PNAS,107:5267-5268
    Cohen S,1941.Nutrition of the Myxomycetes.1.Relations between plasmodia,bacteria and substrate in two membered cultures.Bot.Gaz.,103:205-224
    Kalyanasundaram I,2004.A positive ecological role for tropical Myxomycetes in association with bacteria.Systematics and Geography of Plants,74(2):239-242
    Venkataramani R,Daniel L,1987.Bacterial associates of the slime mould Physarum nicaraguense Macbr.Plant Sciences,97(6):469-473
    Kambly PE,1939.The color of myxomycete plasmodia.American Journal of Botany,26(6):386-390
    宋晓霞,2013.基于生活习性、形态和分子特征对黏菌主要类群系统发育研究.博士学位论文.长春:吉林农业大学
    李姝,亓宝,王琬,王琦,李玉,2014.粉瘤菌内细菌的多样性分析.中国菌物学会会员代表大会,45
    Fiore-Donno AM,Nikolae SI,Nelson M,Pawlowski J,Cavalier-Smith T,Baldauf SL,2010.Deep phylogeny and evolution of slime moulds(Mycetozoa).Protist,161(1):55-57