基于COI基因对混养缅甸蟒个体来源及遗传多样性分析

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英文篇名：Source of Origin and Genetic Diversity of Polyculture Burmese Python( Python bivittatus) Based on COI Gene 作者：樊翠平 ; 段玉宝 ; 田秀华 ; 白素英 英文作者：Fan Cuiping;Duan Yubao;Tian Xiuhua;Bai Suying;College of Wildlife Resource,Northeast Forestry University;College of Forestry,Southweat Forestry University,Key Laboratory of Forest Disaster Warning and Control of Yunnan Province; 关键词：缅甸蟒 ; 个体来源 ; COI ; 遗传多样性 ; 遗传距离 英文关键词：Python bivittatus;;Individual sources;;COI;;Genetic diversity;;Genetic distance 中文刊名：Chinese Journal of Wildlife 英文刊名：2017 机构：东北林业大学野生动物资源学院;西南林业大学林学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室; 出版日期：5 出版单位：[25] 年：2 期：23-1587/S 语种：期刊 页：东盟/缅甸 页数：[26] CN：2310-1490 ISSN：145-149 分类号：2017/5/10

摘要

采用PCR技术首次用缅甸蟒人工养殖混养种群作为实验样本,进行mt DNA COI基因序列扩增,得到28条mt DNA COI基因序列,片段长度为1 428 bp,其中T、C、A和G的含量分别为29.8%、15.5%、27.9%和26.9%,A T的含量(54.8%)高于C G的含量(45.2%)。保守位点(C)占89.6%,变异位点(V)占9.6%,简约信息位点(Pi)占1.7%。根据个体系统发育进化树与群体间遗传距离重新判定缅甸蟒人工养殖混养养殖种群的个体来源,并确定28条养殖个体中8条来自海南,20条来自越南。从遗传距离结果可以看出,缅甸蟒养殖群体与野生缅甸蟒相比,并没有出现明显的遗传分化。
        We obtained 28 Cytochrome oxidase subunit Ⅰ( COI) gene sequences of polyculture burmese python( Python bivittatus) using PCR technology. The length of the COI gene fragment was 1428 bp,of which the content of T,C,A and G is 29. 8%,15. 5%,27. 9%,and 26. 9%,respectively. Content of A T( 54. 8%) was higher than that of C G( 45. 2%). Conservative sites( C) accounted for 89. 6%,mutation loci( V) accounted for 9. 6%,and simple information site( Pi) accounted for 1. 7%. Based on phylogeny trees and genetic distance between individuals,the 28 burmese pythons were considered to be 8 individuals from Hainan Province,China,and 20 individuals from Vietnam. According to genetic distance,there was no obvious genetic differentiation between the domestic and wild populations of burmese python.

引文

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