海洋球石藻（Emiliania huxleyi）病毒硫氧还蛋白（TRX）基因的克隆及生物信息学分析

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• 出版年：2010
• 作者：张彦锋；刘静雯；张稚兰；董双林
• 单位1：集美大学生物工程学院
• 学历：硕士研究生
• 语种：中文
• 作者关键词：海洋球石藻病毒（EhV）；硫氧还蛋白（Trx）；基因克隆及生物信息学分析
• 起始页：293
• 总页数：8
• 经费资助：“十一五”国家科技支撑计划重大项目子课题，2006BAD09A06号；集美大学中青年创新团队专项基金资助，2008A002号。
• 刊名：海洋与湖沼
• 是否内版：否
• 刊频：双月刊
• 创刊时间：1957
• 主办单位：中国海洋湖沼学会；中国科学院海洋研究所
• 主编：相建海
• 地址：青岛南海路7号
• 邮编：266071
• 电子信箱：chenpuyuan@yahoo.cn
• 卷：41
• 期：2
• 期刊索取号：P226.06 449
• 数据库收录：中国百种杰出学术期刊；中国科学院优秀期刊一等奖；中国科协优秀科技期刊一等奖

摘要

首次从海洋球石藻病毒（Emiliania huxleyi virus-EhV 99B1）中克隆了硫氧还蛋白（Trx）基因（该序列已提交GenBank，登录号：GU109280）。系统进化关系分析表明：EhV99B1-Trx与GenBank中已报道的EhV86-Trx（NC_007346）有很高的同源性，核酸及其推导的氨基酸序列的同源性分别为98%和100%，而与其它物种的Trx序列同源性仅为9.8%—18.8%。采用生物信息学方法和工具分析了EhV99B1-Trx的生化参数，预测了该蛋白的高级结构。结果表明：（1）EhV99B1-Trx基因的开放阅读框全长591bp，编码196个氨基酸，蛋白的相对分子量为22.1kDa，理论等电点为5.27；（2）EhV-99Bl-TrxN端蛋白结构域具有保守的Cys-Gly-Pro-Cys（CGPC）硫氧还蛋白氧化还原活性位点氨基酸基序；（3）对该蛋白二、三级结构分析预测结果进一步证实EhV99B1-Trx基因编码的为一种新型的硫氧还蛋白家族成员。