斜带石斑鱼胰蛋白酶原和淀粉酶全长cDNA的克隆与序列分析

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• 出版年：2010
• 作者：胡永乐；梁旭方；王琳；李观贵；刘秀霞；王云新；张海发
• 单位1：暨南大学生命科学技术学院
• 出生年：1986
• 学历：硕士研究生
• 语种：中文
• 作者关键词：胰蛋白酶原；淀粉酶；基因克隆；序列分析；斜带石斑鱼Epinephelus coioides
• 起始页：125
• 总页数：7
• 经费资助：国家科技部863项目(2007AA09Z437)；国家自然科学基金项目(30670367)；广东省科技计划项目(2007B020701002， 2005B20301005)；广东省自然科学基金项目(031886)；教育部留学回国人员科研启动基金项目
• 刊名：热带海洋学报
• 是否内版：否
• 刊频：双月刊
• 创刊时间：1982
• 主管单位：中国科学院
• 主办单位：中国科学院南海海洋研究所
• 主编：张偲
• 电子信箱：jto@scsio.ac.cn
• 网址：http://jto.scsio.ac.cn;http://www.jto.ac.cn
• 卷：29
• 期：5
• 期刊索取号：P226.06842
• 核心期刊：中国自然科学核心期刊

摘要

采用RT-PCR及RACE法从斜带石斑鱼Epinephelus coioides肝胰脏克隆得到胰蛋白酶原(trypsinogen，TRY)与淀粉酶(amylase，AMY)基因cDNA全序列。斜带石斑鱼肝胰脏TRY基因cDNA全长911bp，其中5’非翻译区(5’-UTR)为55bp，3’－UTR为127bp，开放阅读框(ORF)为729bp，编码242个氨基酸，包含所有丝氨酸蛋白酶中共有的高度保守的催化活性中心。序列一致性分析发现，斜带石斑鱼与牙鲆Paralichthys olivaceus、金头鲷Sparusaurata、鳎Solea senegalensis、石鲽Pleuronectes bicoloratus的TRY序列相似性高达86.8%—89.7%，与人Homosapiens、小鼠Mus musculus、斑马鱼Danio rerio的TRY相似性较低为59.9%—64.5%。斜带石斑鱼AMY基因cDNA全长1657bp，其中5'-UTR为41bp，3’-UTR为77 bp，ORF为1539bp，编码512个氨基酸，包含与哺乳动物α-AMY二级结构相似的8个α螺旋和8个β折叠。序列一致性分析发现，斜带石斑鱼与澳洲肺鱼Neoceratodus forsteri、美洲拟鲽Limanda americanus、大西洋鲑Salmo salar、斑马鱼AMY基因序列相似性高达82.4%—91.8%，与人、小鼠、鸡G．Gallus的AMY基因相似性较低为70.1%—72.3%。斜带石斑鱼TRY和AMY基因cDNA全序列的成功克隆为进一步研究其表达调控机理及研发有效提高其表达水平的饲料添加剂奠定基础。