基于基因组SSR标记对中国金针菇的遗传多样性和育种历史研究
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- 论文作者：刘晓斌 ; 冯邦 ; 李静 ; 杨祝良
- 年：2016
- 作者机构：中国科学院昆明植物研究所东亚植物多样性与生物地理学重点实验室;中国科学院大学;云南大学;
- 论文关键词：分子标记 ; 微卫星 ; 菌株鉴定 ; 遗传结构 ; 杂交
- 会议召开时间：2016-08-19
- 会议录名称：中国菌物学会2016年学术年会论文摘要集
- 英文会议录名称：Abstracts of 2016 Mycological Society of China Annual Meeting
- 语种：中文
- 分类号：S646.15
- 学会代码：ZGVL
- 会议名称：中国菌物学会2016年学术年会
- 会议地点：中国福建福州
- 主办单位：中国菌物学会
- 学会名称：中国菌物学会
- 页数：2
- 文件大小：663k
- 原文格式：D
- 会议级别：全国
摘要
金针菇(Flammulina velutipes)隶属于膨瑚菌科(Physalacriaceae),具有重要的食用及经济价值。本研究共收集我国124个金针菇菌株,其中栽培菌株110株,野生菌株14株。基于金针菇基因组数据,开发了均匀分布于其基因组中的25对SSR引物,并在这124个菌株中扩增出153条多态性条带。研究发现,在124个菌株中有65个菌株具有各自特异的条带,可从其它菌株中区分开。其余59个菌株可根据SSR条带异同分为16组,各组内菌株条带相同、可能代表了具有相同遗传背景的菌株,即研究的124个菌株可能总共代表了81种不同遗传背景的菌株,其中110个栽培菌株共有51种不同遗传背景,因此,约53%的栽培菌株存在品种名混乱的现象。遗传多样性和遗传结构研究表明,相对于栽培菌株而言野生金针菇菌株具有较高的遗传多样性和更多的私有等位基因,表明野生金针菇菌株可为栽培菌株的改良提供宝贵基因库。遗传历史研究表明,我国的白色金针菇有三种不同遗传背景的菌株,它们先后由日本引进。黄色栽培金针菇至少有五种不同遗传背景的菌株。首个黄色金针菇栽培品种由采自我国东南部的野生金针菇驯化而来,并曾与最初引进自日本的白色金针菇进行过杂交。此后,在育种中,其它部分黄色金针菇菌株之间及黄色金针菇和白色金针菇菌株之间又曾进行过杂交。
引文
郭美英,1997.我国金针菇新品种的选育.食用菌学报,4(1):8-14.
刘艳芝,2003.我国金针菇遗传育种研究概况.长江蔬菜,12(10):39-41.
王波,鲜灵,2013.金针菇遗传多样性的ISSR分析.西南农业学报,26(4):1593-1599.
陆欢,章炉军,张丹,李开盛,尚晓冬,谭琦,2014.中国金针菇工厂化生产用种SSR和AFLP遗传多样性分析.中国农学通报,30(19):92-97.
Ge ZW,Yang ZL,Zhang P,Matheny PB,Hibbett DS,2008.Flammulina species from China inferred by morphological and molecular data.Fungal Diversity,32(2):59-68.
Mizuno R,Ichinose H,Honda M,Takabatake K,Sotome I,Takai T,Maehara T,Okadome H,Isobe S,Gau M,Kaneko S,2009.Use of whole crop sorghums as a raw material in consolidated bioprocessing bioethanol production using Flammulina velutipes.Bioscience,Biotechnology,and Biochemistry,73(7):1671-1673.
Shi M,Yang Y,Guan D,Zhang Y,Zhang Z,2012.Bioactivity of the crude polysaccharides from fermented soybean curd residue by Flammulina velutipes.Carbohydrate polymers,89(4):1268-1276.
Palapala V,Aimi T,Inatomi S,Morinaga T,2002.ITS-PCR-RFLP method for distinguishing commercial cultivars of edible mushroom,Flammulina velutipes.Journal of food science,67(7):2486-2490.
Park YJ,Baek JH,Lee S,Kim C,Rhee H,Kim H,Seo JS,Park HR,Yoon DE,Nam JY,2014.Whole genome and global gene expression analyses of the model mushroom Flammulina velutipes reveal a high capacity for lignocellulose degradation.PLo S One,9(4):e93560.
Su H,Wang L,Liu L,Chi X,Zhang Y,2008.Use of inter-simple sequence repeat markers to develop strain-specific SCAR markers for Flammulina velutipes.Journal of applied genetics,49(3):233-235.
Zhang R,Hu D,Zhang J,Zuo X,Jiang R,Wang H,Ng TB,2010.Development and characterization of simple sequence repeat(SSR)markers for the mushroom Flammulina velutipes.Journal of bioscience and bioengineering,110(3):273-275.
刘艳芝,2003.我国金针菇遗传育种研究概况.长江蔬菜,12(10):39-41.
王波,鲜灵,2013.金针菇遗传多样性的ISSR分析.西南农业学报,26(4):1593-1599.
陆欢,章炉军,张丹,李开盛,尚晓冬,谭琦,2014.中国金针菇工厂化生产用种SSR和AFLP遗传多样性分析.中国农学通报,30(19):92-97.
Ge ZW,Yang ZL,Zhang P,Matheny PB,Hibbett DS,2008.Flammulina species from China inferred by morphological and molecular data.Fungal Diversity,32(2):59-68.
Mizuno R,Ichinose H,Honda M,Takabatake K,Sotome I,Takai T,Maehara T,Okadome H,Isobe S,Gau M,Kaneko S,2009.Use of whole crop sorghums as a raw material in consolidated bioprocessing bioethanol production using Flammulina velutipes.Bioscience,Biotechnology,and Biochemistry,73(7):1671-1673.
Shi M,Yang Y,Guan D,Zhang Y,Zhang Z,2012.Bioactivity of the crude polysaccharides from fermented soybean curd residue by Flammulina velutipes.Carbohydrate polymers,89(4):1268-1276.
Palapala V,Aimi T,Inatomi S,Morinaga T,2002.ITS-PCR-RFLP method for distinguishing commercial cultivars of edible mushroom,Flammulina velutipes.Journal of food science,67(7):2486-2490.
Park YJ,Baek JH,Lee S,Kim C,Rhee H,Kim H,Seo JS,Park HR,Yoon DE,Nam JY,2014.Whole genome and global gene expression analyses of the model mushroom Flammulina velutipes reveal a high capacity for lignocellulose degradation.PLo S One,9(4):e93560.
Su H,Wang L,Liu L,Chi X,Zhang Y,2008.Use of inter-simple sequence repeat markers to develop strain-specific SCAR markers for Flammulina velutipes.Journal of applied genetics,49(3):233-235.
Zhang R,Hu D,Zhang J,Zuo X,Jiang R,Wang H,Ng TB,2010.Development and characterization of simple sequence repeat(SSR)markers for the mushroom Flammulina velutipes.Journal of bioscience and bioengineering,110(3):273-275.