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影响鸡就巢行为基因的筛选和qRT-PCR验证
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摘要
中国的地方品种鸡资源丰富,但均表现出较强的抱巢性,严重影响了其在实际生产中的经济效益。因此,探讨鸡抱巢的行为机制,在遗传育种上对于提高其产蛋性能具有潜在的经济价值。禽类的就巢行为受下丘脑-垂体-性腺(简称P-G-H)轴的高度调控,前期通过对下丘脑和垂体组织的RNA-Seq筛选到了就巢和非就巢状态下差异表达的基因,通过生物信息学方法深入分析发现:可能与就巢相关的候选基因极显著地富集于Steroid biosynthesis通路上。本研究在此基础上,扩大样本量对筛选到的富集于Steroid biosynthesis通路上的差异基因及与促性腺激素合成相关的转录本进行qRT-PCR验证,分析其mRNA水平上的表达差异。活体采集300日龄正在产蛋和正在就巢的宁都三黄鸡个体各15只,采集其垂体和下丘脑组织抽提RNA,体外反转录合成其cDNA第一链,夸外显子区域设计引物,对筛选到的候选基因进行实时荧光定量PCR研究,以β-actin为内参,检测各基因在就巢期和产蛋期垂体及下丘脑组织中的mRNA表达差异。在就巢期和产蛋期垂体组织中FDFTl,COMT,SC4MOI,CYP51A1,SREBF2,GDF9,PRL基因的表达差异显著(P≤0.05);LSS,CYPllAl,SRD5A2,LIPA,PGR,CGA基因表达差异极显著(P≤0.01)。此外,在就巢期和产蛋期垂体组织中VIPR1的两种转录本VIPR1A3SS和VIPR1201的表达差异显著(P≤≤0.05);PGR基因的两种转录本PGR201和PGRA5SS的表达差异极显著(P≤0.01);而EGR1的两种转录本EGR1A3SS和EGR1瓜的表达存在差异,但未达到统计学显著水平(P>0.05)。在就巢期和产蛋期下丘脑组织中APOA1,CYP19A1,FTR,CGA,GDF10基因的表达均存在差异,但均未达到统计学显著水平(P>0.05)。调控Steroid biosynthesis通路上相关基因表达的转录因子SREBF2在就巢期和产蛋期垂体组织中mRNA表达差显著,且调控促性腺激素α亚基合成的基因CGA和EGR1在就巢期垂体组织中均下调表达;同时调控雌激素合成的关键基因CYP19A1在就巢期下丘脑组织中上调表达。Steroid类物质通常是性激素的合成前体或为其本身,而雌激素常可以通过负反馈调节作用于下丘脑和垂体组织,控制促性腺激素的合成进而影响到卵泡的形成与发育。因此推测:SREBF2、CGA、EGR1、CYP19A1等可能是影响鸡就巢行为的候选基因。
引文

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