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铜氨氧化酶催化反应机理的理论研究
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摘要
铜氨氧化酶(CuAOs)参与生物活性胺的分解与调节,在很多生物体中发挥着至关重要的作用。CuAOs通过自身的铜离子和2,4,5-三羟基苯丙氨酸醌(TPQ)催化伯胺类物质的氧化脱氨反应。它的活性位点是被高度保护的,有TPQ和五配位的单核二价铜离子组成。TPQ与Cu~(2+)的配位形式有两种,分别为"off-copper"和"on-copper",并且这两种形式在溶液中平衡存在。本文主要通过高斯03软件,采用密度泛函理论(DFT)的b3lyp方法,在6-31g++基组水平上,研究了CuAOs半还原反应过程(fig.1)的催化反应机理。计算得到了反应过程中的过渡态,并且得到了反应物、产物、中间体和过渡态的键长键角等重要数据。此外,还利用了密度泛函理论(DFT)的mp2方法计算得到了反应物、产物、中间体和过渡态的单点能。
CuAOs use both copper and 2,4,5-trihydroxyphenylalanine quinone(TPQ) to catalyze the oxidative deamination of primary amines. The CuAO active site is highly conserved and comprised of TPQ and mononuclear type Ⅱ copper center that exhibits five-coordinate. The reaction mechanism of CuAOs are studied by the DFT of B3LYP method at 6-31g~(++)bases level.
引文
[1]Eric M.S.;David M.D.;et al.Acc.Chem.Res.2015,48:1218
    [2]Murakawa T.;Hamaguchi A.;et al.Journal of Biological Chemistry,2015,38:23094

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