蛋白质三级拓扑结构对热稳定性贡献的初步探讨

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• 出版年：2009
• 作者：王霁；张士璀；陈玲玲
• 单位1：中国海洋大学海洋生命学院
• 出生年：1982
• 学历：博士生
• 语种：中文
• 作者关键词：蛋白质；三级结构；拓扑参数；熔解温度；热稳定性
• 起始页：940
• 总页数：7
• 经费资助：国家自然科学基金项目(30570383)资助
• 刊名：中国海洋大学
• 是否内版：否
• 刊频：双月刊
• 创刊时间：1959
• 主管单位：中华人民共和国教育部
• 主办单位：中国海洋大学
• 主编：管华诗
• 地址：青岛市鱼山路5号
• 邮编：266003
• 卷：39
• 期：5
• 期刊索取号：P226.066101-1
• 核心期刊：中国科学技术信息研究所核心期刊；中国科学文献情报中心核心期刊；北京大学图书馆核心期刊

摘要

搜集来自数据库和文献的127个已测定熔解温度和PDB结构的热稳定蛋白，计算了每个蛋白PDB结构的9种拓扑参数，并对各个参数与其自身熔解温度做了线性相关性分析。现有数据结果表明只有CC这个参数与T_m的相关性系数达到了0.33。CC数表征蛋白结构作为天然接触的网络来处理时的簇系数，因此这一关系表明组成蛋白的基团接触的越紧密，蛋白的热稳定性就越高，这与之前的研究结论相一致。而其它的参数没有发现与Tm有显著的关系。作者从拓扑结构这个方面进行研究为蛋白质的热适应机理研究提供了新的思路。