紫色水稻土水稳性团聚体土壤微生物基因组DNA提取方法探讨
- 出版年：2009
- 作者：罗红燕；谢德体；蒋先军
- 单位1：西南大学资源环境学院
- 出生年：1974
- 学历：博士生
- 语种：中文
- 作者关键词：免耕紫色土水稻田土壤；微生物DNA提取；方法比较
- 起始页：223
- 总页数：5
- 经费资助：国家自然科学基金项目(40501033)；国家“十一·五”科技支撑计划(2007BAD87B10)
- 刊名：水土保持学报
- 是否内版：否
- 刊频：双月刊
- 创刊时间：1987
- 主管单位：中国科学院
- 主办单位：中国土壤学会 中国科学院水利部水土保持研究所
- 主编：雷廷武
- 电子信箱：journal@ms.iswc.ac.cn
- 网址：http://www.iswc.ac.cn http://www.periodicals.com.cn
- 卷：23
- 期：5
- 期刊索取号：P396.06144
- 数据库收录：被英国的国际农业与生物科学研究中心数据库收录；被《中国学术期刊光盘版》全文收录；被《中国农业资源环境文摘》《中国生物学文摘》《中国林业文摘》《环境科学文摘》《中国地理科学文摘》等本学科权威性文摘收录
- 核心期刊：中文核心期刊
摘要
为了找到提取土壤微生物总DNA的最佳方法，通过OD值检验、凝胶电泳、PCR和DGGE分析，比较了Reddy法、基于DNAout kit试剂盒改进的实验方法、以及Kuske修订法、Edgcomb改进法、SDS高盐提取法、Eichner调整法等常用的不同土壤微生物基因组的DNA提取方法在亚热带地区长期免耕紫色水稻土水稳性团聚体0.25～2．0mm粒径上的提取效果。结果表明，6种方法都可以从团聚体中提取到长度大于23.1kb的DNA片段，但不同方法提取的DNA的产量存在明显差异，土壤总DNA均不需纯化就可以用于PCR扩增，使用细菌16SrDNA基因V3区的通用引物可扩增得到相应的片段。研究表明，改进的DNAout kit试剂盒法是长期免耕紫色水稻土水稳性团聚体中微生物基因组DNA的最佳提取方法。